Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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