Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Tpm4Q6IRU2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Tpm4Q6IRU2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Tpm4Q6IRU2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Tpm4Q6IRU2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Tpm4Q6IRU2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Tpm4Q6IRU2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Tpm4Q6IRU2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Tpm4Q6IRU2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Tpm4Q6IRU2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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