Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pkp4Q68FH0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pkp4Q68FH0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pkp4Q68FH0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pkp4Q68FH0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pkp4Q68FH0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pkp4Q68FH0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pkp4Q68FH0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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