Protein–RNA interactions for Protein: Q62245

Sos1, Son of sevenless homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sos1Q62245 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sos1Q62245 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sos1Q62245 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sos1Q62245 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sos1Q62245 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sos1Q62245 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sos1Q62245 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sos1Q62245 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sos1Q62245 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sos1Q62245 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sos1Q62245 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sos1Q62245 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sos1Q62245 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sos1Q62245 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sos1Q62245 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sos1Q62245 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sos1Q62245 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sos1Q62245 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sos1Q62245 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sos1Q62245 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sos1Q62245 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sos1Q62245 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sos1Q62245 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sos1Q62245 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sos1Q62245 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sos1Q62245 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.2 ms