Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ccne1Q61457 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms