Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms