Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms