Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms