Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf8Q60846 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms