Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms