Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Foxd4Q60688 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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