Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprnQ60673 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PtprnQ60673 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PtprnQ60673 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PtprnQ60673 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PtprnQ60673 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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PtprnQ60673 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms