Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr2f1Q60632 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms