Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms