Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim58Q5NCC9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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