Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms