Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc3lQ4KL14 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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