Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms