Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rnpc3Q3UZ01 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rnpc3Q3UZ01 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms