Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms