Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U595 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms