Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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