Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms