Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf40Q3U319 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rnf40Q3U319 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rnf40Q3U319 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf40Q3U319 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf40Q3U319 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf40Q3U319 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf40Q3U319 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf40Q3U319 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf40Q3U319 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf40Q3U319 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf40Q3U319 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf40Q3U319 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf40Q3U319 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf40Q3U319 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf40Q3U319 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf40Q3U319 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf40Q3U319 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf40Q3U319 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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