Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms