Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms