Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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