Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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VgfQ0VGU4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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VgfQ0VGU4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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VgfQ0VGU4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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VgfQ0VGU4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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VgfQ0VGU4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VgfQ0VGU4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms