Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms