Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MitfQ08874 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms