Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MestQ07646 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms