Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms