Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms