Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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