Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Thbs3Q05895 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Thbs3Q05895 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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