Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms