Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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NfiaQ02780 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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NfiaQ02780 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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NfiaQ02780 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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NfiaQ02780 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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NfiaQ02780 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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NfiaQ02780 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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NfiaQ02780 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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NfiaQ02780 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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NfiaQ02780 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms