Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms