Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms