Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms