Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms