Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms