Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pkp1P97350 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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