Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx1P81068 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx1P81068 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Irx1P81068 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Irx1P81068 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Irx1P81068 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Irx1P81068 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Irx1P81068 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx1P81068 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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