Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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