Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms