Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfixP70257 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfixP70257 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfixP70257 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfixP70257 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfixP70257 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NfixP70257 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfixP70257 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfixP70257 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfixP70257 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NfixP70257 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NfixP70257 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NfixP70257 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NfixP70257 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms