Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms