Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UbdP63072 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UbdP63072 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UbdP63072 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UbdP63072 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UbdP63072 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms