Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Usp46P62069 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Usp46P62069 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Usp46P62069 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp46P62069 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp46P62069 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms